保税区一日游运作流程分为四个步骤：首先，企业将货物以出口方式报关进入保税区，视同离境可办理出口退税；

其次，货物入区后无需实际存储，直接办理进口报关手续；再次，海关审核通过后，货物从保税区进口至国内；

最后，企业完成进口清关并提取货物。整个流程通常在一天内完成，因此称为“一日游”。该模式利用保税区“境内关外”的政策优势，实现货物“出口不离境”，帮助企业快速完成出口退税和货物结转。